Ο Σύλλογος Ποντίων Φοιτητών και Σπουδαστών Θεσσαλονίκης αρχίζει τη δράση του το 1946, ως μια παρέα ανθρώπων με κοινά πολιτιστικά ενδιαφέροντα και κοινωνικούς προβληματισμούς. Επίσημα η «Ένωση Ποντίων Φοιτητών Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης» ιδρύεται το 1959, στο πλαίσιο της Ευξείνου Λέσχης Θεσσαλονίκης και ξεκινάει οργανωμένα, πλέον, το πολυδιάστατο έργο της. Μετά τη διακοπή των δραστηριοτήτων της κατά τη διάρκεια της δικτατορίας, η «Ένωση» επανιδρύεται το 1975 και μετονομάζεται σε «Σύλλογος Ποντίων Φοιτητών του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης». Με την τροποποίηση του καταστατικού το 1989 ο Σύλλογος πλέον ονομάζεται «Σύλλογος Ποντίων Φοιτητών και Σπουδαστών Θεσσαλονίκης και περιλαμβάνει φοιτητές του Πανεπιστημίου Μακεδονίας, του Αριστοτελείου και των Τ.Ε.Ι. Σίνδου.
Το 2015 ο Σύλλογος γιόρτασε τα 40 χρόνια λειτουργίας με τη σημερινή του επωνυμία. Αξιοσημείωτη είναι η επετειακή εκδήλωση που πραγματοποιήθηκε προς τιμήν των 40 αυτών χρόνων, στις 14 Νοεμβρίου 2015, στην Εύξεινο Λέσχη Θεσσαλονίκης, όπου παλαιά και νέα μέλη του Συλλόγου, μοιράστηκαν συγκινήσεις και μνήμες από την θητεία τους και παρουσιάστηκε διαχρονικά η δράση του Συλλόγου. Στην εκδήλωση ακούστηκαν αφηγήσεις και γεγονότα παλαιότερων ετών, εκτέθηκαν επιστολές, παλαιά βιβλία πρακτικών και καταστατικών καθώς και αφίσες από χορούς και άλλες δράσεις που πραγματοποιήθηκαν, παρουσιάστηκαν ημερολόγια, σενάρια από θεατρικές παραστάσεις καθώς και πληθώρα φωτογραφιών.